自锁妖塔崩毁之后，塔内妖魔尽出，且和人界其他妖魔结成势力欲灭蜀山而后快。通过或明或暗的各种方式进行复仇，其真正目的是夺取女娲玉以及控制神魔之井封印！经过多年大战之后，女娲玉最终破碎成无数残片，而双方也都牺牲惨烈。蜀山在经过多方查探，努力寻找碎片和修复女娲玉的方法。传闻女娲玉乃女娲大神之血所造，不仅是神魔之井封印重要的力量来源，并具有让人得到神族般永生不灭的力量，而《新仙剑》主角们的故事，正是围绕着修复女娲玉而开始……
姚仙认可《新仙剑》主角正统身世
《新仙剑》月华清、玉龙瑶
【月华清、玉龙瑶——唐雪见后裔】
月华清和玉龙瑶为景天与唐雪见的后裔。因为只有神树果实的灵力可以修复女娲玉，两姐妹尚在襁褓中时就选为温养、修复女娲玉碎片的载体。
妖族得知此消息，联合魔族对蜀山发动战争，欲将两个潜在的威胁扼杀在摇篮之中，蜀山深知两女婴的重要性，托人暗中将两姐妹护送下山。但路上护送之人遭遇伏击，护送姐姐之人身亡，姐姐不知所踪；护送妹妹之人身负重伤，勉强把妹妹送交山下一对玉姓夫妇收养，夫妇为其取名龙瑶。
幻冥界之主柳梦璃不愿人妖两族混战，欲往蜀山劝说妖族止戈，路过一山林时捡到断水数日的女婴，为了给女婴续命，为其佩戴了幻瞑界宝玉，梦璃常念当年即墨月色，为其取名月华清。但因柳梦璃常来往人妖两界，不便将月华清带在身边，于是将其交由古修仙门派天墉派为徒。
【南柯子——星璇之子】
南柯子为星璇与王蓬絮之之子，自幼习五灵符法，未及双十，已能引天地风雷之力。星璇夫妇受蜀山之托，护送年幼的月华清与玉龙瑶下山，南柯子与思堂亦随同往。
护送途中为妖族伏击，星璇身殒，王蓬絮与思堂皆化为原形，南柯子也因使用禁术退化为无法长大的灵童，记忆、灵力尽失。后南柯子流落至苗疆小村，村民怜其年幼，予之衣食。南柯子亦每日坚持上山砍柴、摘果，赠予村民作为报答。
南柯子在山中遇到化为原形的思堂，思堂伤感之余，重授其五灵符法。南柯子学习五灵符法进展神速，又多次帮助村民降妖驱鬼，声名乃显，因其居住之村为南柯村，世人皆称其为南柯子，乃以之为名。后为寻找身世之谜，离开村子，灵猫思堂一路相随。
